home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Cream of the Crop 1 / Cream of the Crop 1.iso / EDUCATE / PEDHLP13.ARJ / DATALINK < prev    next >
Text File  |  1990-03-27  |  2KB  |  32 lines
  1.                                                                <DATA>
  2.         LINKAGE pedigree files can be read in directly (handy for
  3.         checking coding). There must be at least two spaces between
  4.         locus codes, and only single spaces between the symbols within a
  5.         locus code, i.e. PEDRAW expects to find codes such as:
  6.  
  7.         2  1 1 1  0 1 0  1 1
  8.  
  9.         PEDRAW expects to find a file with extension .PED to be in a
  10.         format suitable to be read by MAKEPED, and with .PPD if the file
  11.         has been output by MAKEPED. This clashes with the convention
  12.         suggested in the most recent LINKAGE documentation of having the
  13.         former with an extension .DAT and the latter with an extension
  14.         .PED. The PEDRAW convention is the one used by LINKSYS and files
  15.         may have to be renamed accordingly.
  16.  
  17.         LINKAGE files are treated as follows:
  18.  
  19.         1. A unique ID number is constructed by multiplying the
  20.         pedigree number by 1000 and adding the individual number, so
  21.         that individual 2 from pedigree 3 gets an ID of 3002.
  22.  
  23.         2. Each of the locus codes is read into a text line. Single
  24.         spaces within locus codes are removed, so that 0 1 1 becomes
  25.         011.
  26.  
  27.         3. As for LINKSYS files, PEDRAW attempts to guess the diagnosis
  28.         code by assuming that the first locus code is affection status.
  29.         If the first digit of the first locus code is 2 the diagnosis
  30.         code is set to 1 (for solid shading), otherwise it is set to 0
  31.         <ADJUST> <DATADAT -patterns>.
  32.